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          circos(linux下Circos怎么安裝)

          來源:互聯網轉載 時間:2024-05-10 09:13:47

          linux下Circos安裝

          circos下載地址:http://circos.ca/software/download/circos/

          下載后解壓:

          tarxvfzcircos-0.67-pre4.tgz

          然后進去circos-0.67-pre4目錄下的bin目錄

          cdcircos-0.67-pre4/bin

          檢查所需模塊:

          ./circos-modulesok1.26Carpok0.40Cloneok2.63Config::Generalok3.40Cwdok2.145Data::Dumperok2.55Digest::MD5ok2.84File::Basenameok3.40File::Spec::Functionsok0.2301File::Temp

          不是ok的都是缺少的perl模塊,需要手動安裝。

          安裝方法為使用perlCPAN安裝這些perl模塊。命令:

          perl-MCPAN-eshell

          出現下面提示符,即可繼續安裝。

          CPAN[1]>

          以安裝Clone模塊為例,install命令安裝,如下:

          CPAN[1]>installClone

          提示安裝成功即可安裝下一個模塊。

          如perl -MCPAN -e shell命令失敗,出現如下情況:

          Can'tlocateCPAN.pmin@INC(@INCcontains:/usr/local/lib64/perl5/usr/local/share/perl5/usr/lib64/perl5/vendor_perl/usr/share/perl5/vendor_perl/usr/lib64/perl5/usr/share/perl5.).BEGINfailed--compilationaborted.

          則需先安裝perl-CPAN,命令如下:

          yuminstallperl-CPAN

          注意:

          其中GD模塊安裝前需安裝GD作圖庫,命令為:

          yuminstallgd*

          有些模塊安裝可能會失敗,這時候可強制安裝:

          CPAN[1]>forceinstallClone

          所有模塊安裝完后在檢查一遍:

          ./circos-modules

          全部為ok即可。

          標簽:circos-

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