Perl腳本求得反向互補序列函數如下:
subreverse_complement_IUPAC{my$dna=shift;#reversetheDNAsequencemy$revcomp=reverse($dna);#complementthereversedDNAsequence$revcomp=~tr/ABCDGHMNRSTUVWXYabcdghmnrstuvwxy/TVGHCDKNYSAABWXRtvghcdknysaabwxr/;return$revcomp;}subreverse_complement{my$dna=shift;#reversetheDNAsequencemy$revcomp=reverse($dna);#complementthereversedDNAsequence$revcomp=~tr/ACGTacgt/TGCAtgca/;return$revcomp;}用法,以reverse_complement為例:
$str = &reverse_complement($a);
#$a變量里存放序列字符串,$str為求得的反向互補序列。
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