轉錄本的類型是多種多樣的,除了編碼蛋白的RNA外,還有很多非編碼蛋白的RNA, noncoding RNA, 簡稱ncRNA。 在ncRNA中,根據長度又分成兩類,長鏈非編碼RNA, 指的是長度在200bp以上的非編碼RNA, 縮寫為lncRNA; 對于長度在50bp以下的RNA, 統稱為small RNA。
small RNA包含了很多類型的小RNA, 比如miRNA, siRNA等,其中miRNA是研究的最為官方,最為成熟的小RNA。
miRNA是一類長度在18到36bp的非編碼RNA, 關于miRNA長度的范圍有很多說法,也有說是20到24bp之間的,大部分miRNA的長度在21或者22bp左右,miRNA的形成過程如下
首先由miRNA gene轉錄生成初級miRNA轉錄本,簡稱pri-miRNA, pri-miRNA的長度在300到10kbp之間,然后進一步加工生成帶有莖環結構stem-loop的miRNA前體,簡稱pre-miRNA, pre-miRNA長度在70到90bp之間,最后在Dicer
酶切作用下,從pre-miRNA的5’端和3’端分別剪切形成成熟的miRNA, 即mature miRNA, 所以一個pre-miRNA可能產生兩個成熟的miRNA。
關于miRNA的作用機制,研究的也比較清楚。miRNA的功能屬于轉后后修飾調控,主要通過和mRNA的3’UTR區進行結合,結合區域稱之為`seed`,當結合區域的序列完全配對時,誘導mRNA降解, 當只有部分序列配對時,抑制mRNA的翻譯,從而發揮一個負調控的機制, 示意圖如下
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